Protein–RNA interactions for Protein: Q9D420

4933421I07Rik, RIKEN cDNA 4933421I07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933421I07RikQ9D420 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
4933421I07RikQ9D420 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933421I07RikQ9D420 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms