Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rufy3Q9D394 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms