Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krtap5-3Q9D226 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms