Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q6

Erp44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp44Q9D1Q6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Erp44Q9D1Q6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Erp44Q9D1Q6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms