Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Susd3Q9D176 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Susd3Q9D176 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Susd3Q9D176 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Susd3Q9D176 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Susd3Q9D176 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Susd3Q9D176 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms