Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spc24Q9D083 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spc24Q9D083 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms