Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Utp11Q9CZJ1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Utp11Q9CZJ1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms