Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9CYI0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9CYI0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9CYI0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9CYI0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Q9CYI0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9CYI0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CYI0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CYI0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms