Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2fQ9CY34 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2fQ9CY34 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2fQ9CY34 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2fQ9CY34 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2fQ9CY34 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2fQ9CY34 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2fQ9CY34 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2fQ9CY34 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2fQ9CY34 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2fQ9CY34 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2fQ9CY34 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2fQ9CY34 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2fQ9CY34 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2fQ9CY34 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2fQ9CY34 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2fQ9CY34 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2fQ9CY34 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2fQ9CY34 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2fQ9CY34 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2fQ9CY34 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2fQ9CY34 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2fQ9CY34 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube2fQ9CY34 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube2fQ9CY34 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2fQ9CY34 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2fQ9CY34 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2fQ9CY34 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2fQ9CY34 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2fQ9CY34 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2fQ9CY34 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2fQ9CY34 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2fQ9CY34 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2fQ9CY34 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2fQ9CY34 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms