Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx7Q9CY18 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx7Q9CY18 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms