Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXY1

Tmem175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem175Q9CXY1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem175Q9CXY1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem175Q9CXY1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem175Q9CXY1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem175Q9CXY1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms