Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cnih4Q9CX13 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Cnih4Q9CX13 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Cnih4Q9CX13 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnih4Q9CX13 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Cnih4Q9CX13 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Cnih4Q9CX13 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms