Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rpusd4Q9CWX4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms