Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhobtb3Q9CTN4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhobtb3Q9CTN4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms