Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gnpda2Q9CRC9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms