Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ska2Q9CR46 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms