Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klhl28Q9CR40 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.1 ms