Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
4931417E11RikQ9CR05 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
4931417E11RikQ9CR05 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms