Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rer1Q9CQU3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms