Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PompQ9CQT5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PompQ9CQT5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PompQ9CQT5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms