Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PsenenQ9CQR7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PsenenQ9CQR7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms