Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms