Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl35Q9CQL6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl35Q9CQL6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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