Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DenrQ9CQJ6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DenrQ9CQJ6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DenrQ9CQJ6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DenrQ9CQJ6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DenrQ9CQJ6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DenrQ9CQJ6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DenrQ9CQJ6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DenrQ9CQJ6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DenrQ9CQJ6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DenrQ9CQJ6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DenrQ9CQJ6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DenrQ9CQJ6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DenrQ9CQJ6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DenrQ9CQJ6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DenrQ9CQJ6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DenrQ9CQJ6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DenrQ9CQJ6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DenrQ9CQJ6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DenrQ9CQJ6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms