Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQF4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQF4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQF4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQF4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQF4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms