Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rab5aQ9CQD1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rab5aQ9CQD1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rab5aQ9CQD1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rab5aQ9CQD1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rab5aQ9CQD1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rab5aQ9CQD1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rab5aQ9CQD1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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