Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sar1bQ9CQC9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sar1bQ9CQC9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms