Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sike1Q9CPR7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sike1Q9CPR7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sike1Q9CPR7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sike1Q9CPR7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sike1Q9CPR7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sike1Q9CPR7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sike1Q9CPR7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sike1Q9CPR7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sike1Q9CPR7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sike1Q9CPR7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sike1Q9CPR7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sike1Q9CPR7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sike1Q9CPR7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sike1Q9CPR7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sike1Q9CPR7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sike1Q9CPR7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sike1Q9CPR7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sike1Q9CPR7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sike1Q9CPR7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sike1Q9CPR7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sike1Q9CPR7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sike1Q9CPR7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sike1Q9CPR7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sike1Q9CPR7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sike1Q9CPR7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sike1Q9CPR7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sike1Q9CPR7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sike1Q9CPR7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sike1Q9CPR7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sike1Q9CPR7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sike1Q9CPR7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sike1Q9CPR7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sike1Q9CPR7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sike1Q9CPR7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sike1Q9CPR7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sike1Q9CPR7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sike1Q9CPR7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sike1Q9CPR7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sike1Q9CPR7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sike1Q9CPR7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sike1Q9CPR7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sike1Q9CPR7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sike1Q9CPR7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sike1Q9CPR7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sike1Q9CPR7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sike1Q9CPR7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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