Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt23Q99PS0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms