Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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