Protein–RNA interactions for Protein: Q99N28

Cadm3, Cell adhesion molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cadm3Q99N28 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cadm3Q99N28 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms