Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrrtQ99MR6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrrtQ99MR6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms