Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CalcbQ99MP3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CalcbQ99MP3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms