Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms