Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cstf3Q99LI7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cstf3Q99LI7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cstf3Q99LI7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cstf3Q99LI7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cstf3Q99LI7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cstf3Q99LI7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cstf3Q99LI7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cstf3Q99LI7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cstf3Q99LI7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Cstf3Q99LI7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cstf3Q99LI7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Cstf3Q99LI7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cstf3Q99LI7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cstf3Q99LI7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cstf3Q99LI7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cstf3Q99LI7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cstf3Q99LI7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cstf3Q99LI7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cstf3Q99LI7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cstf3Q99LI7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cstf3Q99LI7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cstf3Q99LI7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cstf3Q99LI7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms