Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Usp16Q99LG0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp16Q99LG0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms