Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q99KU6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q99KU6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q99KU6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q99KU6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q99KU6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Q99KU6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q99KU6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q99KU6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q99KU6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q99KU6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q99KU6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q99KU6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q99KU6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q99KU6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q99KU6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q99KU6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q99KU6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q99KU6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q99KU6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q99KU6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q99KU6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Q99KU6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q99KU6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q99KU6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q99KU6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q99KU6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q99KU6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q99KU6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q99KU6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q99KU6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q99KU6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q99KU6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q99KU6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q99KU6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q99KU6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q99KU6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q99KU6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q99KU6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q99KU6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q99KU6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q99KU6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q99KU6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q99KU6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q99KU6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q99KU6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q99KU6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Q99KU6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q99KU6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q99KU6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q99KU6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q99KU6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q99KU6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q99KU6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q99KU6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q99KU6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q99KU6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q99KU6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Q99KU6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q99KU6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Q99KU6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q99KU6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q99KU6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q99KU6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q99KU6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q99KU6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q99KU6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q99KU6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q99KU6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q99KU6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q99KU6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q99KU6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q99KU6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q99KU6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q99KU6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q99KU6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q99KU6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q99KU6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q99KU6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q99KU6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q99KU6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q99KU6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q99KU6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q99KU6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q99KU6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q99KU6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q99KU6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q99KU6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q99KU6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q99KU6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q99KU6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q99KU6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q99KU6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q99KU6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q99KU6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q99KU6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q99KU6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q99KU6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q99KU6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q99KU6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.5 ms