Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lactb2Q99KR3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lactb2Q99KR3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lactb2Q99KR3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lactb2Q99KR3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms