Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pls3Q99K51 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pls3Q99K51 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms