Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tlcd1Q99JT6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tlcd1Q99JT6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms