Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms