Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxp3Q99JB6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxp3Q99JB6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms