Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atg5Q99J83 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg5Q99J83 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms