Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Derl1Q99J56 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Derl1Q99J56 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms