Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CsprsQ99388 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CsprsQ99388 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms