Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmo1Q924W9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmo1Q924W9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmo1Q924W9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo1Q924W9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo1Q924W9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo1Q924W9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo1Q924W9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo1Q924W9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo1Q924W9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo1Q924W9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo1Q924W9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo1Q924W9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo1Q924W9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmo1Q924W9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmo1Q924W9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmo1Q924W9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Lmo1Q924W9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Lmo1Q924W9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmo1Q924W9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmo1Q924W9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Lmo1Q924W9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo1Q924W9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Lmo1Q924W9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo1Q924W9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo1Q924W9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo1Q924W9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmo1Q924W9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Lmo1Q924W9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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Lmo1Q924W9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmo1Q924W9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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