Protein–RNA interactions for Protein: Q924D0

Rtn4ip1, Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4ip1Q924D0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtn4ip1Q924D0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtn4ip1Q924D0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.6 ms