Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp4Q921I6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp4Q921I6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp4Q921I6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp4Q921I6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp4Q921I6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sh3bp4Q921I6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sh3bp4Q921I6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3bp4Q921I6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms