Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q4

Vps16, Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps16Q920Q4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vps16Q920Q4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps16Q920Q4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms