Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb12Q91Y07 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Pcdhb12Q91Y07 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms